shadow passwordと同様に、インストールの時に「パスワードの暗号化にMD5を使うか」と言うようなことを聞かれる。 この場合、NISなどの様に他のコンピュータとパスワードを共有しない場合はMD5を選んでおく。
MD5による暗号化は従来のcrypt()関数より複雑であるのと、最大256文字と言う長いパスワードを選択できるため、辞書攻撃などの攻撃に対して強い。 また、今後MD5が主流となり、PAMなどのユーザー認証システムもMD5を利用するため将来的にもよい。