使わないサービスやプログラムは、消したり、インストールしない。 ちょっとしたプログラムがセキュリティホールを持っていることがあるので注意しましょう。 ちょっと古い話ですと、ApacheをインストールするとついでにインストールされるCGIに致命的なセキュリティホールがあったことがあります。
被害を最小限に抑えるためにも人に見られたら困るデータや消されたら困るデータは置かない用にしましょう。 重要なデータはバックアップを取っておくことも忘れずに。